Морський гідрофізичний інститут НАН України

Вычислительный кластер МГИ НАН Украины представляет собой массив из 11-ти вычислительных узлов, соединенных коммуникационной и транспортной сетями, работающих под управлением своей операционной системы, из которых:

• восемь имеют – каждый по два 4-ядерных процессора Intel Xeon Processor E5440 c частотой 2.83 Ггц, оперативную память объемом 7.8 Гб,

• два – каждый по четыре 6-ядерных процессора Intel Xeon Processor E5645 c частотой 2.4 Ггц, оперативную память объемом 31.4 Гб,

• один – два 4-ядерных процессора Intel Xeon Processor E5607 c частотой 2.27 Ггц, оперативную память объемом 15.65 Гб,

Каждый вычислительный узел оснащен жестким диском объемом 0.5 Тб.

Сети реализованы по технологии Gigabit Ethernet. Транспортная сеть предназначена непосредственно для файлового обмена, а коммуникационная – для высокопроизводительных MPI-вычислений.

В качестве коммутаторов используются 24-хпортовые гигабитные управляемые свитчи:

• для транспортной сети – D-Link DGS-1210-24,

• для коммуникационной – Planet GSW-2404SF.

Для хранения данных используется дисковый массив VessRAID 1740s общей физической емкостью 11 Тб.

Стабильность электропитания вычислительного кластера обеспечивают источники бесперебойного питания UPS APC Smart 3000VA.

Операционная система представляет собой дистрибутив многопользовательской многозадачной сетевой операционной системы линукс – Debian GNU/Linux 6.0 x86_64.

Один из вычислительных узлов является консолью кластера. Доступ к консоли организован по протоколу удаленного доступа Secure SHell.

На консоли кластера находятся серверы сетевой файловой системы NFS и системы локального управления ресурсами Torque. Первая предоставляет общее файловое пространство вычислительным узлам, а вторая – позволяет управлять запуском программ на кластере.

На кластере установлены оптимизирующие 64-битные компиляторы языков Си, Си++ и Фортрана корпорации Intel.

Параллельность вычислений кластера обеспечивает дистрибутив интерфейса передачи сообщений MPI – Mpich2.

Наблюдение за статистикой вычислительных узлов и историей вычислений в реальном времени осуществляется при помощи модернизированного системного монитора Ganglia.

Для оценки эффективности вычислений на кластере использовался тест LinPack, который применяется при формировании списка наиболее производительных вычислительных систем по всему миру (список Top 500). Тест состоит в решении системы линейных алгебраических уравнений вида Ax = f методом LU-разложения, где A - матрица размерности NxN. Максимальная достигнутая производительность вычислительного кластера составляет 0,51 TFlops при N = 98500.